生物信息技术

  • 3D UMAP R分析代码

    # LOAD LIBRARIES ##### Restart Rstudio or R# Run the following code once you have Seurat installed library(ggplot2) libr…

    单细胞测序 06/23/2021
    427
  • R:Bioconductor设置国内镜像

    Bioconductor安装包出现无法打开url https://bioconductor.org/install/,可以通过修改国内镜像解决,代码如下: 运行安装命令 BiocManager::install(“DOSE&#8…

    01/09/2021
    651
  • had non-zero exit status

    解决方案1:install.packages(‘*package_name’, dependencies = TRUE)

    Python 11/07/2020
    314
  • edgeR:RNAseq差异基因比较

    Empirical analysis of digital gene expression data in R 安装: source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)bioc…

    08/14/2020
    303
  • Clustal:多序列比对分析、序列同源性分析

    Clustal是一个单机版的基于渐进比对的多序列比对工具,由Higgins D.G.等开发。有应用于多种操作系统平台的版本,包括linux版,DOS版的clustlw,clustalx等。CLUSTAL是一种渐进的比对方法,先将多个序列两两…

    07/12/2020
    762
  • R:cnetplot的使用

    cnetplot用于Gene-Concept Network,将位于一个GO Terms下的基因用线连接起来。 cnetplot(x, showCategory = 5, foldChange = NULL, layout = “kk”, …

    R 05/16/2020
    1.5K
  • ggplot2数据可视化cheatsheet速查表中文版

    网盘下载1   网盘下载2  提取码: q3yv

    05/06/2020
    337
  • 利用R语言批量创建、移动、删除、修改文件

    1.如何获取和更改当前工作目录 # 获取当前目录getwd() # 设置工作目录setwd(“C:/Users”) 2.创建文件和目录 可以使用dir.create函数在R中创建一个新文件夹或目录,如下所示: dir…

    04/09/2020
    1.8K
  • 利用R语言批量修改文件名file.rename函数

    R语言中文件操作的函数有: file.create(…, showWarnings = TRUE)file.exists(…)file.remove(…)file.rename(from, to)file…

    03/25/2020
    1.2K
  • Python学习资源总结

    前言 知乎:路人甲 微博:玩数据的路人甲 微信公众号:一个程序员的日常   在知乎分享已经有一年多了,之前一直有朋友说我的回答能整理成书籍了,一直偷懒没做,最近有空仔细整理了知乎上的回答和文章另外也添加了一些新的内容,完成了几本小…

    03/23/2020
    389