CRISPR基因编辑
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Star Protocol: 从宏基因组中提取 CRISPR 靶向序列
基于同源性的搜索通常用于从宏基因组中发现移动遗传元件 (MGE)，但它在很大程度上依赖于数据库中的参考基因组。 该方法可以在不使用参考数据库的情况下从组装的人宏基因组序列中提取 CRISPR 靶向序列。 我们描述了宏基因组重叠群的组装、CR…
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gRNA Design在线设计网站资源
Green Listed – a CRISPR Screen ToolDesign gRNAs for custom CRISPR screens targeting a long or short list of genes …
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CRISPResso 深度测序数据分析CRISPR Cas9基因组编辑效果
CRISPResso是一个强大且易于使用的计算流程，能够准确量化和可视化CRISPR-Cas9的结果，以及全面评估其对编码序列、功能性非编码元素和非靶点的影响。该算法允许对非同源末端连接（NHEJ）和同源定向修复（HDR）频率进行量化。 C…
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CRISPR敲入同源臂的理想长度是多少？
基因敲除物（<2 kb）的同源臂的理想长度是多少？长的基因敲除物（>5 kb）的同源臂的理想长度是多少？ 在果蝇中，长度为0.5-2 kb的同源臂可以很容易地用于敲除。在蚊子中，0.5-1 kb的同源臂适用于敲除<2 kb…
