生物技术
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ggplot2绘图教程
直方图:geom_histogram 分组直方图的排列方式 position=”dodge” ggplot(small)+geom_histogram(aes(x=price, fill=cut), position=”dodge”) ht…
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STAMP:微生物物种与功能组成的可视化软件
STAMP是一款分析微生物物种与功能组成的可视化软件,STAMP 1.0于2010年发表在Bioinformatics杂志,后期2014年的2.0版本同样在Bioinformatics发布,目前最新版本为2.1.3。该软件除了能够绘制探索性…
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R:使用R连接数据库处理数据
1.数据库连接 library(DBI) library(dplyr) library(dbplyr) library(odbc) con <- dbConnect(odbc::odbc(), “Oracle DB”) 2.使用DBI…
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单细胞 RNA 测序方法的比较分析Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods
单细胞RNA测序(scRNA-seq)为解决生物和医学问题提供了新的可能性。然而,缺乏对各种scRNA-seq协议性能的系统比较。我们从583个小鼠胚胎干细胞生成数据,以评估六种scRNA-seq方法:CEL-seq2、Drop-seq、M…
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在R中安装Git/Github
1.查看是否安装Git命令: 执行安装命令: which git ## /usr/bin/git 查看 git –version 版本: git –version ## git version 2.35.1 2.Windows系统 安装…
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2022年1月 精选最新R包
Agriculture ALUES v0.2.0: Provides functions for fuzzy modeling to evaluate land suitability for different crops product…
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XlsxWriter:用Python创建操作Excel xlsx文件
XlsxWriter 是一个 Python 模块,可用于将文本、数字、公式和超链接写入 Excel 2007+ XLSX 文件中的多个工作表。 它支持格式化等功能,包括: 100% 兼容 Excel XLSX 文件。完全格式化。合并单元格。…
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空间转录组学分析包-Spatial transcriptomics Packages
Merfishtools – [Python] – MERFISHtools implement a Bayesian framework for accurately predicting gene or tran…
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Navigator Error:check_hostname requires server_hostname
An unexpected error occurred on Navigator start-up Main Error check_hostname requires server_hostname Traceback Tracebac…
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序列比对
比较是科学研究中最常见的研究方法之一,通过比较寻找研究对象可能具备的某些特征和特性。序列比较的理论基础是进化学说:如果两个序列之间具有足够高的相似性,那么两者可能是共同的进化祖先经过序列内残基的替换,残基或序列片段的缺失或插入以及序列重组等…