实验方法
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AUC分析和ROC Curve解读
在机器学习中，性能测量是一项必不可少的任务。因此，当涉及分类问题时，我们可以使用 AUC – ROC 曲线。当我们需要检查或可视化多类分类问题的性能时，我们会使用 AUC（Area Under the Receiver Oper…
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Star protocols：用于分析微生物学细胞图像的深度学习框架
Before you begin Deep learning (DL) has proven to be extremely effective in addressing a range of major biological chall…
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全基因组测序和分析Whole genome sequencing (WGS) and analysis
使用改良的SDS/蛋白酶K方法提取噬菌体裂解液的基因组DNA。简单地说，将200μL高滴度噬菌体裂解液（>109 pfu/ml）与等体积的裂解缓冲液（10 mM Tris, 10 mM EDTA, 100 μg/mL蛋白酶K, 100…
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利用ImageJ Fiji分析WesternBlot条带
http://lukemiller.org/index.php/2010/11/analyzing-gels-and-western-blots-with-…
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RNA immunoprecipitation RNA免疫共沉淀方法
RNA免疫共沉淀方法：RIP is an antibody-based technique used to map in vivo RNA-protein interactions and RNA modifications such as…
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人外周血 T 细胞分离方法
本节介绍从全血中分离外周血单个核细胞 (PBMC) 和pan T 细胞富集的方法。在分离 PBMC 时，可以使用多种不同的来源样品（如：全血、血沉棕黄层、白细胞减少系统室等）。 注意：所有步骤都应在层流环境中进行，使用适当的无菌技术。1.确…
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CRISPR PX330 sgRNA质粒克隆构建方法
sgRNA design Figure 1. From Staying on target with CRISPR-Cas . Dana Carroll , Nature Biotechnology 31,807–809 (201…
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小鼠基因型PCR鉴定方法
1.将小鼠剪尾巴0.5~1cm左右。2.添加 200 µl Direct PCR 裂解缓冲液和 10 µl 蛋白酶 K（20mg/ml，-20 oC）。3.65 oC 孵育过夜。4.在 85 oC下加热样品 45 分钟以灭活蛋白酶 K。5.…
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计算单位体积质粒的拷贝数（copy number）
第一步，计算质粒的分子量。假设一个DNA碱基对（bp）的平均重量为650道尔顿（Da），一摩尔的碱基对（bp）的重量为650克，即任何双链DNA模板的分子量可以通过取其长度（bp）与每个碱基对重量的乘积来估计。 First, …
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流式细胞仪（FACS）原理及其应用注意事项
流式细胞术(FCM)定义: FCM是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞理化特性进行多参数定量分析和分选的技术。 特点: 单细胞的流动的， 活细胞的 定量的，多参数的，高统计学精度的，分选细胞。 (一）仪器基本组成结构 …
