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R: Load in data from 10X
Description Enables easy loading of sparse data matrices provided by 10X genomics. Usage Read10X( data.dir, gene.column …
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R:读取Excel的xls和xlsx格式文件
#安装加载readxl包 library(“readxl”) #读取xlsx文件 file<-read_excel(“xxx.xlsx”) #读取表sheet read_excel(xl…
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AUC分析和ROC Curve解读
在机器学习中，性能测量是一项必不可少的任务。因此，当涉及分类问题时，我们可以使用 AUC – ROC 曲线。当我们需要检查或可视化多类分类问题的性能时，我们会使用 AUC（Area Under the Receiver Oper…
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ggsci:ggplot2科学期刊主题调色板
1.介绍 ggsci 提供一系列高质量的调色板，其灵感来自于科学期刊、数据可视化图书馆、科幻电影和电视节目中使用的颜色。.The color palettes in ggsci are available as ggplot2 scales…
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利用R读取h5ad文件
安装包 install.packages(“remotes”)remotes::install_github(“mojaveazure/seurat-disk”,force = TRUE) 加…
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R:使用clusterProfiler进行DAVID GO富集分析
require(DOSE) require(clusterProfiler) data(geneList) gene = names(geneList)[abs(geneList) > 2] david = enrichDAVID(g…
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R:使用GOplot对GO分析结果作图
安装 # Installation of the latest released version install.packages(‘GOplot’) # Installation of the latest development ver…
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R：UniProt.ws包转换Accession，ENSEMBL，ENSEMBL_PROTEIN等
UniProt.ws提供了一个通往UniProt网络服务的选择查询接口。UniProt.ws是与Bioconductor的Uniprot网络服务互动的基础包。 与AnnotationDb对象允许对许多其他注释包进行选择一样，UniProt.…
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R:计算数据框中每一行的标准偏差
RowSD = function(x) {sqrt(rowSums((x – rowMeans(x))^2)/(dim(x)[2] – 1))}
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rconfig:在命令行管理 R 配置
Configuration management using files (JSON, YAML, separated text), JSON strings, and command line arguments. Command lin…
